Çorum'un İskilip ilçesinde doğdu. İlköğrenimini ve İmam-Hatip Lisesi öğrenimini İskilip'te tamamladı.
1995 yılında üniversite eğitimini tamamlayarak aynı yıl Ankara Üniversitesi İlahiyat Fakültesinde yüksek lisans eğitimine başladı.
İskilip, Çubuk, Ankara’da İmam-Hatip; Sungurlu ve Niğde'de Vaiz olarak görev yaptı. Şanlıurfa Harran İlçe Müftülüğü, Niğde ve Yozgat İl Müftü Yardımcılığı görevlerinde bulundu. 2026 yılında ise Tokat İl Müftü Yardımcılığı görevine atandı.
Hâlen Tokat İl Müftü Yardımcısı olarak görevini sürdürmektedir.
Arapça bilen Mustafa Balcıoğlu, evli ve üç çocuk babasıdır.